Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf18Q8BM39 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf18Q8BM39 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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