Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SgtaQ8BJU0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtaQ8BJU0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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