Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim23Q8BGX0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim23Q8BGX0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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