Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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Htatsf1Q8BGC0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Htatsf1Q8BGC0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms