Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ChfrQ810L3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ChfrQ810L3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms