Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z25

Ofd1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ofd1Q80Z25 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ofd1Q80Z25 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms