Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8Q80YR6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp8Q80YR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms