Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cul9Q80TT8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cul9Q80TT8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms