Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec18aQ7TSQ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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