Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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