Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScocQ78YZ6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScocQ78YZ6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScocQ78YZ6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScocQ78YZ6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms