Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc6aQ78XR0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms