Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmed3Q78IS1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmed3Q78IS1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms