Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SynmQ70IV5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SynmQ70IV5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms