Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms