Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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