Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Glis3Q6XP49 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms