Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc44a1Q6X893 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms