Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd1Q6PIP5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms