Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med16Q6PGF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms