Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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