Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms