Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac4Q6NZM9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms