Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Soga3Q6NZL0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms