Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Asic1Q6NXK8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asic1Q6NXK8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asic1Q6NXK8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asic1Q6NXK8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asic1Q6NXK8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms