Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdcd11Q6NS46 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms