Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms