Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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