Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms