Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ParpbpQ6IRT3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms