Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt40Q6IFX3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt40Q6IFX3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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