Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgap20Q6IFT4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms