Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Fbxo27Q6DIA9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fbxo27Q6DIA9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo27Q6DIA9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fbxo27Q6DIA9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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