Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop58Q6DFW4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop58Q6DFW4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms