Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms