Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms