Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf1Q64213 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms