Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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ScxQ64124 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ScxQ64124 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ScxQ64124 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
ScxQ64124 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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ScxQ64124 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ScxQ64124 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms