Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pan3Q640Q5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pan3Q640Q5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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