Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc18Q640L5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc18Q640L5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms