Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phc1Q64028 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phc1Q64028 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms