Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic2Q62520 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic2Q62520 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic2Q62520 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic2Q62520 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms