Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms