Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcncQ62447 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms