Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall3Q62255 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms