Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpaQ62189 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms