Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema3bQ62177 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms