Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkciQ62074 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkciQ62074 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkciQ62074 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkciQ62074 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkciQ62074 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkciQ62074 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms