Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Phox2aQ62066 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Phox2aQ62066 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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