Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npm1Q61937 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms